Example for promoter recognition program

The annotated sequences of the genes zen (FBgn0004053) was retrieved from FlyBase (http://flybase.bio.indiana.edu/genes/)
The promoter (transcription start 3187) does contain TATA-box sequence (3162..3168).

Enter sequence in plain format
from Screen (cut & paste)...
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from File:
Graphics mode

Confidence Level (The higher value allows to get the more hits.)	Forward strand
Interval [0 .. 1] Nucleosome Potential	Reverse strand
Promoter types (TATA+ means TATA-containing promoter, DPE+ means DPE-containing promoter)


D.melanogaster TATA+	D.melanogaster TATA-	D.melanogaster DPE+

About

Author: Victor Levitsky
Contributors: Sergey V. Lavryushev
Leader: Prof. N.A. Kolchanov