rSNP_Repotr: P0rSNP0J0006

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rSNP_Report: P0rSNP0J0006
Mutation -114C/T in the distal CCAAT-box of the G gamma-globin gene promoter diminishes this box binding to unknown ubiquitus CCAAT-binding factor
rSNP_DB: rSNP0J0006
SYSTEM: T0rSNP0J0006
SYSTEM: T0rSNP0J0006a
TF-site Score			WT					-114C/T				Euclidean distances									Student's t-scaled similarity
MATRIX tools			(+)		(-)			(+)		(-)		X++		X+-			X-+		X--		X++		X+-		X-+		X--	Result
1	AP-1		0,4		-0,4			0,3		0,1		1.59		0.75			1.72		1.00		-0.67		-0.63		-1.73		0.19
2	ATF		0,2		-0,2			0,2		-0,2		1.63		0.86			1.56		0.71		-0.72		-0.74		-1.56		0.48
3	c-Fos		-0,2		0,4			0,1		0,6		1.47		1.76			0.65		1.15		-0.56		-1.63		-0.65		0.04
4	c-Jun		-0,2		0,4			-0,2		0,5		1.51		1.74			0.61		1.06		-0.60		-1.62		-0.62		0.13
5	c-Myb		-0,4		-0,1			0,3		-0,1		1.89		1.44			1.39		0.66		-0.97		-1.31		-1.40		0.53
6	COUP		0,6		-0,5			0,2		-0,6		1.93		0.62			2.12		1.09		-1.01		-0.49		-2.13		0.11
7	CP-1		1		-0,2			0,5		-0,3		1.44		0.10			2.09		1.52		-0.53		0.03		-2.10		-0.33	X+-
8	CRE-BP1		0		-0,2			-0,1		-0,1		1.78		1.19			1.39		0.41		-0.86		-1.06		-1.40		0.78
9	CREB		-0,3		0,2			-0,3		0,3		1.69		1.74			0.73		0.84		-0.78		-1.62		-0.74		0.35
10	E2		-0,2		-0,1			-0,5		-0,4		2.11		1.58			1.44		0.32		-1.20		-1.45		-1.45		0.88
11	E2F		-0,4		-0,6			-0,4		-0,6		2.56		1.72			1.95		0.46		-1.64		-1.59		-1.96		0.74
12	EN		-0,1		0,2			-0,2		0,6		1.53		1.66			0.83		1.05		-0.62		-1.53		-0.84		0.15
13	ER		-0,2		0,5			-0,2		0,3		1.49		1.71			0.56		1.00		-0.57		-1.58		-0.56		0.19
14	Ets		-0,3		-0,4			-0,3		-0,4		2.26		1.53			1.66		0.15		-1.34		-1.41		-1.67		1.05
15	GAGA		0		-0,4			-0,2		-0,5		2.11		1.24			1.75		0.39		-1.19		-1.12		-1.76		0.81
16	GAL4		-0,1		-0,4			-0,3		-0,5		2.19		1.38			1.73		0.30		-1.28		-1.25		-1.74		0.89
17	GATA		-0,4		-0,2			-0,3		-0,3		1.75		1.00			1.60		0.70		-0.84		-0.88		-1.61		0.49
18	GR		-0,2		-0,1			-0,1		-0,1		1.84		1.37			1.27		0.35		-0.92		-1.24		-1.28		0.84
19	HNF1		-0,15		0,05			-0,10		0,1		1.66		1.45			1.01		0.60		-0.75		-1.33		-1.02		0.59
20	HNF3		0,2		-0,5			0,2		-0,3		1.90		0.88			1.84		0.73		-0.99		-0.75		-1.85		0.46
21	HSF		-0,5		-0,4			-0,4		-0,5		2.45		1.76			1.74		0.33		-1.54		-1.64		-1.74		0.87
22	IRF-1		-0,3		-0,2			-0,3		-0,2		2.06		1.53			1.39		0.13		-1.15		-1.41		-1.40		1.06
23	MEF-2		0,2		-0,4			0,3		-0,5		1.91		0.86			1.89		0.81		-0.99		-0.73		-1.89		0.39
24	MyoD		-0,1		-0,4			-0,3		-0,5		2.19		1.38			1.73		0.30		-1.28		-1.25		-1.74		0.89
25	NF-E2		-0,2		0,3			-0,1		0,5		1.51		1.67			0.73		1.02		-0.60		-1.54		-0.74		0.18
26	NF-IL6		0,5		0,3			0,2		0,2		0.96		0.97			1.21		1.21		-0.04		-0.84		-1.22		-0.02
27	NF-kB		-0,2		-0,2			-0,2		-0,2		1.96		1.40			1.40		0.19		-1.05		-1.27		-1.40		1.00
28	OCT		-0,6		0			-0,5		-0,1		2.22		1.92			1.22		0.51		-1.30		-1.79		-1.23		0.68
29	PR		-0,3		-0,4			-0,4		-0,4		2.30		1.59			1.67		0.18		-1.38		-1.46		-1.68		1.01
30	RAR		0		0,6			-0,3		0,3		1.36		1.67			0.54		1.11		-0.44		-1.55		-0.54		0.08
31	RF-X		0		-0,4			0		-0,3		1.96		1.12			1.67		0.43		-1.05		-1.00		-1.67		0.76
32	RXR		0,5		-0,5			0,3		-0,4		1.83		0.59			2.01		1.02		-0.91		-0.46		-2.02		0.17
33	Sp-1		-0,6		-0,1			-0,7		-0,1		2.36		2.02			1.35		0.58		-1.44		-1.89		-1.36		0.62
34	SRF		0,4		0,2			0,4		0,1		1.08		0.88			1.33		1.17		-0.17		-0.75		-1.34		0.02
35	T3R		-0,1		0,5			-0,2		0,2		1.43		1.61			0.62		0.96		-0.51		-1.48		-0.63		0.23
36	TCF-1		0,2		0,3			0,1		0		1.24		1.11			1.07		0.92		-0.33		-0.99		-1.08		0.28
37	TTF-1		0		-0,3			0,3		-0,3		1.84		1.02			1.66		0.66		-0.92		-0.89		-1.67		0.53
38	USF		-0,1		-0,3			-0,2		-0,4		2.05		1.31			1.60		0.24		-1.13		-1.18		-1.60		0.95
39	YY1		-0,1		0,2			-0,2		0,1		1.58		1.45			0.92		0.67		-0.67		-1.32		-0.93		0.52
DNA/protein-Binding		WT				-114C/T					Robustness		SL			CL		UPGA		WPGA				UPCA		WPGA			WM
		1				0,5					D2		CP-1			IRF-1		CP-1		CP-1				CP-1		CP-1			CP-1
X-site		(+)		(-)		(+)			(-)		ED		CP-1			CP-1		CP-1		CP-1				CP-1		CP-1			CP-1
X++		1		1		0,5			0,5		MD		CP-1			CP-1		CP-1		CP-1				CP-1		CP-1			CP-1
X+-		1		-0,29		0,5			-0,29		CD		CP-1			CP-1		CP-1		CP-1				CP-1		CP-1			CP-1
X-+		-0,29		1		-0,29			0,5		W		CP-1			CP-1		CP-1		CP-1				CP-1		CP-1			CP-1
X--		-0,29		-0,29		-0,29			-0,29		PrI		T3R			MyoD		MyoD		MyoD				MyoD		MyoD			MyoD