rSNP_Report: P0rSNP0J0003

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rSNP_Report: P0rSNP0J0003
The -133C/G mutation in the human platelet glycoprotein Ibbeta gene promoter disrupts a WT-complex of DNA binding to nuclear proteins (CHRF and HEL cells)
rSNP_DB: rSNP0J0003
SYSTEM: T0rSNP0J0003
SYSTEM: T0rSNP0J0003a
TF-site Score			WT					-133C/G				Euclidean distances									Student's t-scaled similarity
MATRIX tools			(+)		(-)			(+)		(-)		X++		X+-			X-+		X--		X++	X+-			X-+		X--	Result
1	AP-1		0		-0,2			0		0,1		1.57		1.10			1.30		0.67		-0.54	-0.64			-0.72		0.54
2	ATF		0,1		-0,2			0,1		-0,2		1.52		0.93			1.37		0.65		-0.49	-0.46			-0.79		0.55
3	c-Fos		-0,6		0			-0,4		0		1.93		1.72			1.03		0.55		-0.90	-1.26			-0.46		0.66
4	c-Jun		-0,3		0,2			-0,3		0,2		1.57		1.54			0.83		0.77		-0.63	-1.18			-0.35		0.55
5	c-Myb		0,3		0			0,3		0,2		1.27		1.00			1.37		1.12		-0.33	-0.64			-0.89		0.21
6	COUP		-0,2		-0,6			-0,1		-0,5		2.06		1.24			1.70		0.41		-1.12	-0.88			-1.22		0.91
7	CP-1		-0,2		-0,2			-0,2		-0,2		1.72		1.23			1.23		0.29		-0.78	-0.87			-0.75		1.03
8	CRE-BP1		-0,2		-0,3			0		-0,3		1.79		1.20			1.39		0.38		-0.85	-0.84			-0.90		0.95
9	CREB		-0,3		-0,3			-0,3		-0,3		1.89		1.34			1.34		0.09		-0.95	-0.98			-0.86		1.23
10	E2		-0,4		0,2			-0,3		0,3		1.67		1.53			0.86		0.55		-0.73	-1.17			-0.38		0.77
11	E2F		-0,4		-0,2			-0,5		-0,3		1.93		1.49			1.25		0.22		-0.99	-1.13			-0.77		1.10
12	EN		-0,2		-0,2			-0,2		-0,2		1.72		1.23			1.23		0.29		-0.78	-0.87			-0.75		1.03
13	ER		-0,7		-0,3			-0,4		-0,3		2.20		1.75			1.38		0.37		-1.26	-1.39			-0.90		0.96
14	Ets		-0,3		-0,3			-0,4		-0,3		1.91		1.36			1.34		0.09		-0.88	-0.90			-0.76		1.12
15	GAGA		0,1		0,3			0,2		-0,2		1.17		1.13			1.01		0.96		-0.15	-0.67			-0.43		0.25
16	GAL4		0,2		0,3			0,1		0,3		1.11		1.21			1.03		1.14		-0.08	-0.75			-0.46		0.06
17	GATA		-0,2		1			0,1		0,3		1.24		1.91			0.55		1.56		-0.21	-1.45			0.02		-0.35	X-+
18	GR		-0,6		0,9			-0,6		0,9		1.93		2.45			0.98		1.79		-0.90	-1.99			-0.40		-0.58
19	HNF1		-0,4		-0,5			-0,6		-0,5		2.20		1.54			1.60		0.35		-1.17	-1.08			-1.03		0.86
20	HNF3		-0,4		0,1			-0,6		0,2		1.78		1.68			0.96		0.75		-0.75	-1.21			-0.39		0.46
21	HSF		-0,3		-0,4			-0,3		-0,4		1.97		1.34			1.46		0.10		-1.04	-0.98			-0.98		1.22
22	IRF-1		-0,6		-0,4			-0,6		-0,2		2.22		1.72			1.46		0.39		-1.28	-1.36			-0.98		0.93
23	MEF-2		-0,8		0,3			-0,8		0,3		2.11		2.17			1.00		1.12		-1.17	-1.81			-0.52		0.21
24	MyoD		0,4		0,3			0,3		0,3		1.01		1.13			1.25		1.34		-0.08	-0.77			-0.76		-0.02
25	NF-E2		0,1		0,5			0,1		0,4		1.11		1.45			0.90		1.29		-0.17	-1.09			-0.42		0.03
26	NF-IL6		0,6		-0,2			0,7		-0,4		1.50		0.82			1.89		1.42		-0.56	-0.46			-1.41		-0.09
27	NF-kB		-0,3		-0,3			-0,2		-0,3		1.87		1.32			1.34		0.16		-0.93	-0.96			-0.86		1.16
28	OCT		-0,2		-0,2			-0,2		-0,2		1.72		1.23			1.23		0.29		-0.78	-0.87			-0.75		1.03
29	PR		0,4		-0,5			0,2		-0,5		1.70		0.67			1.83		0.95		-0.76	-0.31			-1.35		0.38
30	RAR		-0,4		-0,2			-0,4		-0,1		1.89		1.48			1.21		0.29		-0.95	-1.12			-0.73		1.03
31	RF-X		-0,3		0,5			-0,2		0,1		1.41		1.63			0.53		0.97		-0.47	-1.27			-0.05		0.36
32	RXR		-0,5		-0,2			-0,3		-0,2		1.95		1.54			1.23		0.26		-1.01	-1.18			-0.75		1.06
33	Sp-1		-0,1		-0,3			-0,1		-0,4		1.75		1.11			1.40		0.35		-0.81	-0.75			-0.92		0.97
34	SRF		-0,6		-0,2			-0,5		-0,2		2.10		1.68			1.30		0.34		-1.16	-1.32			-0.82		0.99
35	T3R		-0,4		-0,2			-0,4		-0,2		1.90		1.47			1.22		0.22		-0.96	-1.11			-0.74		1.11
36	TCF-1		-0,4		-0,2			-0,2		0,2		1.87		1.52			1.23		0.58		-0.93	-1.16			-0.75		0.74
37	TTF-1		-0,6		-0,6			-0,6		-0,6		2.42		1.75			1.75		0.52		-1.39	-1.29			-1.17		0.69
38	USF		-0,5		-0,2			0		-0,1		1.92		1.53			1.26		0.47		-0.89	-1.06			-0.69		0.74
39	YY1		0,1		0,3			0,3		0,1		1.18		1.23			1.05		1.10		-0.15	-0.76			-0.48		0.11
DNA/protein-Binding		WT				-133C/G					Robustness		SL			CL		UPGA		WPGA				UPCA		WPGA			WM
		1				0					D2		GATA			GATA		GATA		GATA				GATA		GATA			GATA
X-site		(+)		(-)		(+)			(-)		ED		GATA			GATA		GATA		GATA				GATA		GATA			GATA
X++		1		1		0			0		MD		GATA			GATA		GATA		GATA				GATA		GATA			GATA
X+-		1		-0,34		0			-0,34		CD		GATA			GATA		GATA		GATA				GATA		GATA			GATA
X-+		-0,34		1		-0,34			0		W		GATA			GATA		GATA		GATA				GATA		GATA			GATA
X--		-0,34		-0,34		-0,34			-0,34		PrI		GATA			GATA		GATA		GATA				GATA		GATA			GATA