rSNP_Repotr: P0rSNP0J0007

rSNP_Guide							rSNP_Tools								Home							Help
rSNP_Report: P0rSNP0J0007
Mutation -94C/G in the Factor VII gene promoter eliminates one band of the gel mobility shift assay with HeLa nuclear extract
rSNP_DB: rSNP0J0007
SYSTEM: T0rSNP0J0007
SYSTEM: T0rSNP0J0007a
TF-site Score			WT					-94C/G				Euclidean distances									Student's t-scaled similarity
MATRIX tools			(+)		(-)			(+)		(-)		X++		X+-			X-+		X--		X++		X+-		X-+		X--	Result
1	AP-1		-0,3		0,4			-0,3		0,3		1.49		1.80			0.73		1.24		-0.27		-1.53		-0.31		0.18
2	ATF		-0,3		0,1			-0,3		0,1		1.61		1.58			0.95		0.89		-0.39		-1.31		-0.53		0.53
3	c-Fos		0,5		0,2			0,7		0,4		1.24		1.43			1.80		1.93		-0.02		-1.16		-1.38		-0.51
4	c-Jun		0,5		0,2			0,7		0,4		1.24		1.43			1.80		1.93		-0.02		-1.16		-1.38		-0.51
5	c-Myb		0,4		-0,3			0,6		-0,3		1.58		0.89			1.95		1.45		-0.36		-0.63		-1.53		-0.03
6	COUP		0,3		-0,7			0		-0,7		1.97		0.76			2.07		0.98		-0.75		-0.49		-1.65		0.44
7	CP-1		0,2		-0,4			-0,2		-0,3		1.65		0.85			1.62		0.79		-0.43		-0.59		-1.21		0.63
8	CRE-BP1		-0,3		-0,2			-0,4		0		1.81		1.48			1.22		0.62		-0.59		-1.21		-0.81		0.80
9	CREB		0		0,1			0,1		0,1		1.35		1.31			1.19		1.15		-0.13		-1.05		-0.78		0.27
10	E2		-0,2		-0,4			0,1		-0,3		1.87		1.22			1.58		0.71		-0.65		-0.96		-1.17		0.71
11	E2F		-0,7		-0,3			-0,5		-0,3		2.22		1.79			1.35		0.35		-1.00		-1.53		-0.93		1.07
12	EN		-0,5		-0,4			-0,5		-0,4		2.15		1.59			1.46		0.14		-0.93		-1.32		-1.04		1.28
13	ER		-0,10		0,20			-0,1		0,2		1.38		1.48			1.00		1.14		-0.16		-1.21		-0.58		0.28
14	Ets		0,3		-1			0,2		-1		2.35		1.02			2.48		1.28		-1.13		-0.75		-2.06		0.14
15	GAGA		-1		0,7			-0,8		0,7		2.28		2.74			0.96		1.79		-1.06		-2.47		-0.55		-0.37
16	GAL4		0,2		-0,9			0,6		-0,8		2.29		1.12			2.44		1.40		-1.07		-0.85		-2.02		0.02
17	GATA		-1		0,2			-1		0,2		2.38		2.44			1.09		1.22		-1.16		-2.18		-0.67		0.20
18	GR		-0,5		1			-0,5		1		1.87		2.64			1.00		2.12		-0.65		-2.38		-0.59		-0.70
19	HNF1		-0,7		-0,9			-0,7		-0,9		2.79		1.92			2.12		0.63		-1.57		-1.66		-1.71		0.79
20	HNF3		-0,9		0			-0,9		0		2.33		2.22			1.15		0.91		-1.11		-1.95		-0.73		0.51
21	HSF		-0,5		-0,7			-0,5		-0,7		2.42		1.61			1.84		0.28		-1.20		-1.34		-1.42		1.14
22	IRF-1		-0,5		-0,4			-0,5		-0,4		2.15		1.59			1.46		0.14		-0.93		-1.32		-1.04		1.28
23	MEF-2		-0,7		-0,4			-1		-0,4		2.45		1.98			1.55		0.56		-1.23		-1.71		-1.14		0.86
24	MyoD		0,3		-0,7			0,3		-0,7		1.99		0.81			2.16		1.17		-0.77		-0.54		-1.74		0.25
25	NF-E2		0,2		0,2			0,2		0,1		1.15		1.24			1.28		1.35		0.07		-0.97		-0.86		0.07
26	NF-IL6		-0,4		-0,5			-0,4		-0,5		2.15		1.46			1.59		0.14		-0.93		-1.19		-1.17		1.28
27	NF-kB		-0,3		0,2			-0,3		0,2		1.57		1.66			0.87		1.03		-0.35		-1.39		-0.46		0.39
28	OCT		-0,5		-0,9			-0,5		-0,6		2.54		1.63			1.99		0.41		-1.32		-1.37		-1.58		1.01
29	PR		-0,2		-0,6			-0,5		-0,6		2.15		1.31			1.73		0.33		-0.93		-1.04		-1.32		1.09
30	RAR		-0,2		1			-0,3		1		1.59		2.45			1.06		2.15		-0.37		-2.19		-0.65		-0.73
31	RF-X		-0,4		0			-0,3		0		1.75		1.60			1.02		0.74		-0.52		-1.33		-0.61		0.68
32	RXR		0,5		-0,3			0,5		-0,3		1.51		0.76			1.94		1.44		-0.29		-0.49		-1.53		-0.02
33	Sp-1		-0,7		1			-0,7		0,3		1.86		2.50			0.41		1.72		-0.64		-2.23		0.01		-0.30	X-+
34	SRF		-0,6		-0,2			-0,6		-0,2		2.10		1.76			1.22		0.45		-0.88		-1.49		-0.81		0.97
35	T3R		-0,2		0,9			-0,2		0,9		1.52		2.32			1.00		2.02		-0.29		-2.05		-0.58		-0.60
36	TCF-1		-0,9		-0,3			-0,9		0		2.55		2.26			1.45		0.84		-1.33		-1.99		-1.04		0.58
37	TTF-1		-0,3		-0,3			-0,3		-0,3		1.89		1.36			1.36		0.40		-0.66		-1.09		-0.95		1.02
38	USF		0		-0,2			0		-0,2		1.57		1.09			1.41		0.82		-0.35		-0.82		-0.99		0.60
39	YY1		-0,4		0,4			-0,4		0,7		1.72		2.09			0.93		1.51		-0.50		-1.82		-0.52		-0.09
DNA/protein-Binding		WT				-94C/G					Robustness		SL			CL		UPGA		WPGA				UPCA		WPGA			WM
		1				0					D2		Sp1			Sp1		Sp1		Sp1				Sp1		Sp1			Sp1
X-site		(+)		(-)		(+)			(-)		ED		Sp1			Sp1		Sp1		Sp1				Sp1		Sp1			Sp1
X++		1		1		-0,50			-0,50		MD		T3R			YY1		T3R		Sp1				T3R		Sp1			GR
X+-		1		-0,50		0			-0,50		CD		Sp1			Sp1		Sp1		Sp1				Sp1		Sp1			Sp1
X-+		-0,50		1		-0,50			0		W		Sp1			Sp1		Sp1		Sp1				Sp1		Sp1			Sp1
X--		-0,50		-0,50		-0,50			-0,50		PrI		E2F			E2F		E2F		E2F				E2F		GAGA			MEF-2